吉林铁道职业技术学院设有多个学院，包括但不限于以下几个：
东北亚高铁学院
铁道机车车辆学院
铁道运输学院
高铁综合技术学院
铁道工程学院
铁道电气学院
城市轨道交通学院
智能制造学院
大数据商务学院
机械工程学院
管理学院
马克思主义学院
公共教学部
体育部
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